Elle est détruite en 1854 lors du percement de la [[rue des Écoles (5e)]], son portail a été remonté en partie contre l'[[Hôtel de Cluny]]<ref>[http://www.patryst.com/fr-FR/curiosities/1825-portail-de-saint-benoit-le-betourne-14e-siecle Portail de Saint-Benoît-le-Bétourné (14e siècle)]</ref>.
Cette église est citée dans [[le Dit des rues de Paris]].