Dû à la famille de Jussieu, dont plusieurs membres furent des botanistes distingués, voisinage du [[Jardin des Plantes de Paris(quartier)|Jardin des Plantes]]. L'[[allée Jussieu]], dans le Jardin des Plantes, fait également référence à cette famille.
Précédemment partie de la [[rue Saint-Victor]], antérieurement rue du Faubourg Saint-Victor, et rue Jussieu. En 1973, la partie située au droit de la [[place Jussieu]] a été réunie à cette dernière.